MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 40984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015508	GCC	2	6	114021	114026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715486
2002	NC_015508	GT	3	6	114034	114039	0 %	50 %	50 %	0 %	332715486
2003	NC_015508	CCA	2	6	114040	114045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715486
2004	NC_015508	CGGC	2	8	114049	114056	0 %	0 %	50 %	50 %	332715486
2005	NC_015508	ATG	2	6	114139	114144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715486
2006	NC_015508	CGG	2	6	114154	114159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715486
2007	NC_015508	GAC	3	9	114204	114212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715486
2008	NC_015508	TGC	2	6	114291	114296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715486
2009	NC_015508	GCG	2	6	114343	114348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715486
2010	NC_015508	AGGCAT	2	12	114364	114375	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332715486
2011	NC_015508	ACA	2	6	114444	114449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715486
2012	NC_015508	ACG	2	6	114642	114647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715486
2013	NC_015508	TCA	2	6	114663	114668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715486
2014	NC_015508	CG	3	6	114688	114693	0 %	0 %	50 %	50 %	332715486
2015	NC_015508	GC	3	6	114763	114768	0 %	0 %	50 %	50 %	332715486
2016	NC_015508	CAT	2	6	114782	114787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715486
2017	NC_015508	AGC	2	6	114797	114802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715486
2018	NC_015508	GAC	2	6	115033	115038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715487
2019	NC_015508	ACG	2	6	115121	115126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715487
2020	NC_015508	CAA	2	6	115143	115148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715487
2021	NC_015508	GCC	2	6	115150	115155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715487
2022	NC_015508	GGA	2	6	115194	115199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715487
2023	NC_015508	CAA	2	6	115239	115244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715487
2024	NC_015508	CGA	2	6	115254	115259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715487
2025	NC_015508	GGCG	2	8	115287	115294	0 %	0 %	75 %	25 %	332715487
2026	NC_015508	GCG	2	6	115331	115336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715487
2027	NC_015508	ATC	2	6	115417	115422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715487
2028	NC_015508	CGC	2	6	115433	115438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715487
2029	NC_015508	GAGGCG	2	12	115444	115455	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	332715487
2030	NC_015508	GGA	2	6	115509	115514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715487
2031	NC_015508	ATC	2	6	115576	115581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715487
2032	NC_015508	CGG	2	6	115698	115703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715487
2033	NC_015508	GAA	2	6	115747	115752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715487
2034	NC_015508	GCC	2	6	115787	115792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715487
2035	NC_015508	GAG	2	6	115822	115827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715487
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2037	NC_015508	GAC	2	6	115882	115887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715487
2038	NC_015508	GGA	2	6	115983	115988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715487
2039	NC_015508	GC	4	8	115994	116001	0 %	0 %	50 %	50 %	332715487
2040	NC_015508	ACA	2	6	116027	116032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715487
2041	NC_015508	CCG	2	6	116099	116104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715487
2042	NC_015508	GCG	2	6	116163	116168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715487
2043	NC_015508	GAAC	2	8	116178	116185	50 %	0 %	25 %	25 %	332715487
2044	NC_015508	CCTC	2	8	116294	116301	0 %	25 %	0 %	75 %	332715487
2045	NC_015508	GAG	2	6	116320	116325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715487
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2051	NC_015508	CTGG	2	8	116763	116770	0 %	25 %	50 %	25 %	332715488
2052	NC_015508	CAA	2	6	116810	116815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715488
2053	NC_015508	GAT	2	6	116859	116864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715489
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2055	NC_015508	A	6	6	116963	116968	100 %	0 %	0 %	0 %	332715489
2056	NC_015508	CT	3	6	117028	117033	0 %	50 %	0 %	50 %	332715489
2057	NC_015508	TCA	2	6	117050	117055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715489
2058	NC_015508	TCGCG	2	10	117068	117077	0 %	20 %	40 %	40 %	332715489
2059	NC_015508	CAT	2	6	117081	117086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715489
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2061	NC_015508	AAC	2	6	117160	117165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715489
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2063	NC_015508	CAGC	2	8	117481	117488	25 %	0 %	25 %	50 %	332715490
2064	NC_015508	CCG	3	9	117532	117540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715490
2065	NC_015508	TCGG	2	8	117543	117550	0 %	25 %	50 %	25 %	332715490
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2080	NC_015508	GTC	2	6	118528	118533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715492
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2083	NC_015508	CG	3	6	118689	118694	0 %	0 %	50 %	50 %	332715492
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2094	NC_015508	TCG	2	6	119197	119202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715493
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2104	NC_015508	CCCG	2	8	119610	119617	0 %	0 %	25 %	75 %	332715493
2105	NC_015508	GC	3	6	119620	119625	0 %	0 %	50 %	50 %	332715493
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2119	NC_015508	TCG	2	6	120813	120818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715494
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2121	NC_015508	TCG	2	6	120882	120887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715494
2122	NC_015508	GCT	2	6	121165	121170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715495
2123	NC_015508	GGC	2	6	121288	121293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715495
2124	NC_015508	GAC	2	6	121480	121485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715495
2125	NC_015508	CAG	2	6	121522	121527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715495
2126	NC_015508	CGA	2	6	121545	121550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715495
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2132	NC_015508	AAGT	2	8	121715	121722	50 %	25 %	25 %	0 %	332715495
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2151	NC_015508	CGC	2	6	122485	122490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715495
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2230	NC_015508	TCA	2	6	126291	126296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715498
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2232	NC_015508	CGAAC	2	10	126331	126340	40 %	0 %	20 %	40 %	332715498
2233	NC_015508	AGC	2	6	126365	126370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715498
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2235	NC_015508	CGG	2	6	126516	126521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715498
2236	NC_015508	GTC	2	6	126523	126528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715498
2237	NC_015508	GAC	2	6	126532	126537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715498
2238	NC_015508	GCC	2	6	126559	126564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715498
2239	NC_015508	GCC	2	6	126634	126639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715498
2240	NC_015508	CCGG	2	8	126657	126664	0 %	0 %	50 %	50 %	332715498
2241	NC_015508	GCC	2	6	126676	126681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715498
2242	NC_015508	GGATCG	2	12	126765	126776	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	332715498
2243	NC_015508	CGC	2	6	126814	126819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715498
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2351	NC_015508	CGGG	2	8	132738	132745	0 %	0 %	75 %	25 %	332715505
2352	NC_015508	CG	3	6	132797	132802	0 %	0 %	50 %	50 %	332715505
2353	NC_015508	GCA	2	6	132996	133001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715505
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2356	NC_015508	GAT	2	6	133057	133062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715505
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2358	NC_015508	GAC	2	6	133096	133101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715505
2359	NC_015508	ACC	2	6	133114	133119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715505
2360	NC_015508	GC	3	6	133254	133259	0 %	0 %	50 %	50 %	332715505
2361	NC_015508	TGAG	2	8	133278	133285	25 %	25 %	50 %	0 %	332715505
2362	NC_015508	ACG	2	6	133363	133368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715505
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2364	NC_015508	G	6	6	133626	133631	0 %	0 %	100 %	0 %	332715506
2365	NC_015508	CTTT	2	8	133745	133752	0 %	75 %	0 %	25 %	332715506
2366	NC_015508	GA	3	6	133761	133766	50 %	0 %	50 %	0 %	332715506
2367	NC_015508	GC	3	6	133785	133790	0 %	0 %	50 %	50 %	332715506
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2483	NC_015508	CCA	2	6	139326	139331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715510
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2485	NC_015508	GTCG	2	8	139443	139450	0 %	25 %	50 %	25 %	332715510
2486	NC_015508	TGT	2	6	139460	139465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715510
2487	NC_015508	TGAAGA	2	12	139487	139498	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332715510
2488	NC_015508	CTT	2	6	139569	139574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715510
2489	NC_015508	GC	3	6	139627	139632	0 %	0 %	50 %	50 %	332715510
2490	NC_015508	CAG	2	6	139655	139660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715510
2491	NC_015508	CGT	2	6	139673	139678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715510
2492	NC_015508	T	6	6	139715	139720	0 %	100 %	0 %	0 %	332715510
2493	NC_015508	CAA	2	6	139724	139729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715510
2494	NC_015508	TGGAGG	2	12	139820	139831	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	332715510
2495	NC_015508	GGC	3	9	139911	139919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715510
2496	NC_015508	GGC	2	6	139926	139931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715510
2497	NC_015508	CTG	3	9	140139	140147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715511
2498	NC_015508	CAT	2	6	140183	140188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715511
2499	NC_015508	CAG	2	6	140239	140244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715511
2500	NC_015508	TCA	2	6	140299	140304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715511

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